Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc5lQ6A068 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc5lQ6A068 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms