Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrmQ64674 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms