Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcncQ62447 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms