Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Traf4Q61382 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf4Q61382 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Traf4Q61382 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf4Q61382 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms