Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Meis1Q60954 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms