Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mfsd3Q5U419 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mfsd3Q5U419 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms