Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf12Q5SPL2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms