Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav6-2Q5R1I4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav6-2Q5R1I4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms