Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rapgef6Q5NCJ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms