Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q504N7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q504N7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q504N7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q504N7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q504N7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms