Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2al1nQ497L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1nQ497L1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms