Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt35Q497I4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms