Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms