Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms