Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Garnl3Q3V0G7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms