Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc114Q3UX62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms