Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BB287469Q3UT53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BB287469Q3UT53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms