Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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D13Ertd608eQ3UPR8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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