Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc34Q3UI66 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms