Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam35aQ3UEN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam35aQ3UEN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms