Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hvcn1Q3U2S8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hvcn1Q3U2S8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms