Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q3U1D9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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