Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Palb2Q3U0P1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms