Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc136Q3TVA9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc136Q3TVA9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms