Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms