Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms