Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms