Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb38Q3LR78 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zbtb38Q3LR78 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zbtb38Q3LR78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms