Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cass4Q08EC4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms