Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp2Q08652 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms