Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox12Q04890 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms