Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms