Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mark3Q03141 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mark3Q03141 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms