Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax5Q02650 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms