Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkcqQ02111 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkcqQ02111 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms