Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smn1P97801 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smn1P97801 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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