Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx2P81066 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx2P81066 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx2P81066 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms