Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cct7P80313 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cct7P80313 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cct7P80313 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms