Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1bP70700 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1bP70700 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms