Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErfP70459 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErfP70459 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErfP70459 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ErfP70459 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ErfP70459 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErfP70459 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErfP70459 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms