Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra8P70278 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra8P70278 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms