Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SbdsP70122 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SbdsP70122 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SbdsP70122 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms