Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp2P63044 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp2P63044 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp2P63044 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp2P63044 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp2P63044 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp2P63044 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp2P63044 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp2P63044 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp2P63044 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp2P63044 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp2P63044 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms