Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3cP62823 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms