Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm5P62322 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm5P62322 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm5P62322 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms