Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo4P61969 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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