Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ActbP60710 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ActbP60710 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ActbP60710 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ActbP60710 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms