Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms