Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp3P59055 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms