Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms